在结构生物学和蛋白质研究中，圆二色性（Circular Dichroism, CD）光谱是一种重要的工具，广泛应用于蛋白质二级结构分析、构象变化监测以及热稳定性评估。CD光谱提供了对蛋白质折叠状态的快速、非破坏性检测手段，但其数据解读高度依赖于计算工具和算法的支持。当前主流的CD数据分析平台包括BeStSel和DichroWeb，两者均被广泛采用，却在算法原理、分析精度和适用场景上各有千秋。本文将围绕“CD光谱分析工具怎么选”这一核心问题，从功能、算法精度、适配性等维度对BeStSel与DichroWeb进行深入解析，为结构生物学研究人员提供实用参考。

一、什么是CD光谱分析？为什么离不开计算工具？

CD光谱是由手性分子对圆偏振光吸收差异产生的谱图，蛋白质的不同二级结构（α-螺旋、β-折叠、无规卷曲）在190–260 nm波长区间具有特征信号。由于CD信号强度弱且各结构的谱图高度重叠，单靠肉眼难以精确判断蛋白结构组成比例，这便凸显了计算工具的重要性。

※ 理想的CD分析工具应具备以下特征：

• 高准确性：可区分相似的结构特征，如平行与反平行β折叠；
• 高通量兼容性：支持批量分析与自动化处理；
• 数据库依赖度低：避免因参考数据库偏差导致的误判；
• 用户友好性强：便于非结构生物学背景的研究者操作。

二、BeStSel：结构解析的“β折叠专家”

※ 核心优势

BeStSel（Beta Structure Selection）专为高分辨β结构判定而设计，特别适用于富含β-结构的蛋白质。其算法不仅识别总β含量，还能进一步细分为平行与反平行构型，解决了传统算法难以区分β类型的难题。

• 独特算法：基于广泛的实验参考光谱库，结合支持向量机（SVM）回归优化，提升分类准确率。
• 结构敏感性强：尤其在β-结构占比高的蛋白中表现出色。
• 支持跨物种数据：算法不依赖单一数据库，适配多种生物样本。

※ 潜在局限

BeStSel对α-螺旋富集蛋白的适配性相对较弱，若研究对象为膜蛋白或天然无序蛋白，建议搭配其他工具辅助分析。

三、DichroWeb：通用型CD数据处理平台

※ 核心优势

DichroWeb是一个成熟的CD光谱分析平台，提供多种算法选择（如CONTIN、CDSSTR、SELCON3等），适合大多数水溶性蛋白的结构评估。其优势在于算法灵活性高、参考数据库丰富，尤其适合进行批量数据比对和交叉验证。

• 多算法支持：可根据样本特性选择最适合的拟合模型。
• 操作界面友好：支持在线数据提交和图形化输出结果。
• 数据库权威：集成多个经验证的数据集，提高预测稳定性。

※ 潜在局限

DichroWeb对极端结构或人工蛋白质的分析准确性有所下降，且较依赖参考数据库的代表性。

四、BeStSel vs.DichroWeb：怎么选？

CD光谱作为蛋白结构研究中的常规技术，其分析质量高度依赖工具算法的选择与使用策略。BeStSel和DichroWeb各具优势，并非互斥，而是应被视为互补的分析组件。在未来的结构生物学研究中，合理整合多工具的能力将直接决定数据解释的深度与准确性。百泰派克生物科技构建了完善的CD数据分析与结构预测服务体系，结合自主优化的数据处理流程与多平台工具互补机制，确保客户获得更加精确且可重复的蛋白结构信息。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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